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16S与代谢组
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16S测序主要研究群落的物种组成、物种间的进化关系以及群落的多样性。通过选择16S rDNA某个或某几个变异区域,选择通用引物对环境样本(肠道、土壤、水体等)微生物进行PCR扩增,然后对PCR产物进行高通量测序,并将得到的测序数据与已有的16S rDNA数据库进行比对分析,从而对环境群落多样性进行研究。代谢组学可以无偏向性的检测细胞、组织、器官或者生物体内受到刺激或扰动前后所有小分子代谢物(主要是相对分子量1000 Da以内的内源性小分子化合物)的动态变化,并通过生信分析筛选差异代谢物,对差异代谢物进行通路分析,揭示其变化的生理机制。16S与代谢组学的数据联合分析可以从多层次揭示特定菌群与代谢物之间的关联性,筛选出引起菌群代谢状态或功能性代谢小分子改变的关键菌株。
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