高深度血液蛋白组
> 技术简介
血液样本具有以下几个优势:
1.血液具有复杂的蛋白质构成,反映着不同部位的蛋白亚群分布特征。
2.血液样本易于获得。
3.血液可动态反应机体的状态变化,这有利于更全面的了解疾病的发生发展进程。
4.血液的采集方法已经成熟,对于血液的其他临床指标也有成熟的检测技术,可以为研究者提供更全面的信息。
蛋白质是血液样本中最重要的大分子物质,其可作为生物功能的直接执行者,其变化可作为标志物来表征疾病的发生与发展。但是,血液样本中存在许多高丰度蛋白,例如血清白蛋白占血液中蛋白总量的80%以上。因此,我们在对血清/血浆样本进行蛋白质组学研究时,需要对其进行去高丰度或富集低丰度蛋白的处理。
> 技术原理
研究借助磁珠的比表面积大及吸附活性高的优点对血液中的低丰度蛋白进行富集。
> 技术优势
高深度:一次可鉴定2500+蛋白
实验操作简单
高稳定性和重复性
样本适用范围广,无物种限制
> 应用领域
生物标志物研究、疾病机制研究、药物作用靶点研究、用药及预后研究、细胞异质性研究、特殊功能蛋白筛选。
> 技术路线
> 实验仪器
Orbitrap Exploris™ 480(Thermo Fisher)
Orbitrap Exploris™ 240(Thermo Fisher)
Q Exactive HF-X(Thermo Fisher)
Orbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™(Thermo Fisher)
Orbitrap Fusion™ Tribrid™(Thermo Fisher)
> 数据分析
数据质控结果;蛋白定性定量结果;蛋白差异分析;火山图(Volcano);表达丰度箱式图;平行样本相关性分析;主成分分析(PCA);层次聚类分析(Heatmap);表达模式聚类分析;数据交叠分析(Venn);差异蛋白GO功能注释及富集分析;差异蛋白Pathway功能注释及富集分析;蛋白互作网络构建;个性化定制分析