脂质代谢组
> 技术简介
脂质组学研究对象主要包括脂肪酸、甘油脂、甘油磷脂、鞘脂、固醇脂、孕烯醇酮脂、糖脂、多聚乙烯共八类。脂质结构的多样性赋予了脂质多种重要的生物功能。脂质不仅参与膜结构的形成,还参与能量转换、物质运输、信息识别与传递、细胞发育和分化及细胞凋亡等过程,并且脂质的异常代谢还与某些疾病,如动脉硬化症、糖尿病、肥胖症、阿尔茨海默症以及肿瘤的发生发展密切相关。
近年来,随着快速、高通量、高精度脂质分析技术的发展,特别是电离离子化技术和高分辨质谱技术在脂质分析中的应用,已经可以实现对生物样品中各种微量脂质进行快速、高通量、高精度的分析检测,使得规模性、整体性的脂质分析及其代谢和功能研究得以实现,“脂质组学”应运而生。脂质组学研究类似于其他“组学”,是利用规模性的技术方法,通过对生命体、组织或细胞等的脂质组以及与其相互作用的分子进行系统研究,揭示生命体的多样性脂质及其代谢调控与生物功能,进而深入探索其与细胞、器官、生命体的生理、病理等过程之间的关系。
> 技术原理
脂质代谢物结构较为复杂,按极性可分为极性脂类(如甘油磷脂、鞘脂)和非极性脂类(如甘油酯、胆固醇)。基于不同头部结构、碳链长度、双键数量等导致的极性差异使得不同类别的脂质可在色谱上被分离。而不同脂质离子化的母离子和通过碰撞池时碎裂产生的子离子也不同,针对这两点特性,色谱与质谱联用可对脂质进行定性和定量分析。
> 技术优势
高覆盖度:无偏向检测所有代谢物,可高达上千种
高重现性: 基于UPLC系统,代谢物保留时间CV值低
高通量:可高速检测样品,样品数量无上限
> 应用领域
疾病标志物筛选、疾病机制研究、药物作用靶点研究、用药及预后研究、植物抗逆研究、营养吸收机制研究、发育机制研究、稀有物种研究、特殊功能蛋白质筛选。
> 技术路线
> 实验仪器
UPLC- Xevo G2-XS QTOF (Waters)
UPLC- TripleTOF 6600+ (AB SCIEX)
Orbitrap Exploris 240 (Thermo Fisher)
> 数据分析
数据质控结果
差异代谢物定性、定量结果
PCA、OPLS-DA、PLS-DA
Venn图
相关性和聚类分析
pathway分析