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修饰位点鉴定
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> 技术简介
由于蛋白质发生修饰后其分子质量会发生相应的改变,同时质谱能够精确测定蛋白质或多肽分子质量,根据这一特性,开始将质谱应用于蛋白质翻译后修饰的鉴定。但由于翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,检测前首先需要对修饰蛋白质或肽段进行富集,再进行质谱鉴定。
> 技术原理
蛋白样品中,发生磷酸化的蛋白和肽段含量极低,且存在各种非磷酸化肽段和无机盐的干扰,需要对磷酸化蛋白或肽段进行富集才能进行有效的质谱检测。金属氧化物TiO2亲和纯化是一种常用的磷酸化肽段富集方法。在酸性条件下,TiO2表面带正电,可以与磷酸化肽段发生静电作用而达到吸附的目的。样本经酶切后,用TiO2微球对磷酸化肽段进行富集,富集后的产物由高精度质谱分析,并通过专业软件Maxquant完成数据检索。
> 技术优势
高效性:TiO2富集效率高达95%,可提高修饰肽段检测效率
高精确度:基于高精度的Obitrap质谱分析,对修饰位点精确鉴定
> 应用领域
疾病机理研究、植物抗逆研究、作物机制研究、位点修饰验证
> 技术路线
> 实验仪器
Q Exactive HF-X(Thermo Fisher)
Orbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™(Thermo Fisher)
Orbitrap Exploris™ 480(Thermo Fisher)
Orbitrap Exploris™ 240(Thermo Fisher)
Orbitrap Fusion™ Tribrid™(Thermo Fisher)
> 数据分析
数据质控结果
磷酸化位点鉴定结果
蛋白GO功能注释
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